Urząd Komitetu Integracji Europejskiej funkcjonuje od 10 października 1996 r. Pełni funkcje koordynacyjne wobec wszystkich resortów i instytucji bezpośrednio zaangażowanych w proces integracji Polski z Unią Europejską. Jest kontynuacją Biura do Spraw Integracji Europejskiej i Biura do Spraw Pomocy Zagranicznej, stanowiących komórki organizacyjne Urzędu Rady Ministrów, powstałe mocą Uchwały Nr 11/91 Rady Ministrów z dnia 26 stycznia 1991 r. w sprawie ustanowienia Pełnomocnika Rządu do Spraw Integracji Europejskiej oraz Pomocy Zagranicznej, a zapewniające obsługę prac Pełnomocnika Rządu.

Priorytetowe zadania UKIE (do 1 maja 2004 r.)

• przyspieszenie prac nad harmonizacją prawa polskiego z prawem wspólnotowym - zakres zmian w prawie polskim wymaga przyspieszenia prac rządowych i parlamentarnych nad projektami ustaw europejskich, poprzez stworzenie specjalnego instrumentu koordynacji tych prac, jakim był Narodowy Program Przygotowania do członkostwa RP w UE (NPPC) oraz ustanowienie specjalnej procedury postępowania z takimi projektami. W ramach realizacji tego priorytetu Urząd opiniował również projekty aktów prawnych co do ich zgodności z prawem UE oraz dokonywał oceny przebiegu procesów dostosowawczych.
  
• wzmocnienie koordynacji resortowej - sprawne przeprowadzenie procesu niezbędnych zmian legislacyjnych, jak również innych działań dostosowawczych związanych z przygotowaniem instytucjonalnym, wymagało sprawnego współdziałania wszystkich instytucji odpowiadających za poszczególne zadania. Było to szczególnie ważne w aspekcie przyspieszenia prac legislacyjnych, zarówno na etapie prac rządowych, jak i parlamentarnych. Podjęcie przez Radę Ministrów decyzji o zakończeniu prac związanych z przyjmowaniem ustaw europejskich w 2001 r. wymagało dotrzymywania przyjętych terminów przez wszystkie ministerstwa i urzędy centralne.
  
• rozwój działalności informacyjnej rządu na temat procesu integracji - w związku z wejściem w decydującą fazę procesu przygotowań do członkostwa w Unii Europejskiej, UKIE w ramach swych zadań przygotował i realizuje Program Informowania Społeczeństwa (PIS). Sprawą istotną było dotarcie do jak najszerszego kręgu odbiorców z rzetelnymi i przystępnymi informacjami, dotyczącymi integracji europejskiej oraz utrzymanie społecznego poparcia dla naszego członkostwa w Unii. UKIE prowadzi również współpracę z organizacjami pozarządowymi i samorządowymi.
  
• oparcie działań zmierzających do uzyskania członkostwa w UE na pogłębionej strategii, wynikającej ze szczegółowej analizy kosztów i korzyści tego procesu (prof. dr hab. Juliusz Kotyński - Korzyści i koszty członkostwa Polski w Unii Europejskiej, Instytut Koniunktur i Cen Handlu Zagranicznego, Warszawa 2000 r.) - dobre członkostwo Polski w Unii będzie w dużym stopniu uzależnione od przyjętej sekwencji i czasu przeprowadzenia niezbędnych działań dostosowawczych. Zadaniem Urzędu było - przy współpracy ministerstw i urzędów centralnych - zapewnienie, opierając się na wykonanych analizach, opracowania optymalnego harmonogramu tych działań.